english

IDENTYFIKACJA MOLEKULARNA MIKROORGANIZMÓW

 

Metoda identyfikacji mikroorganizmów w oparciu o analizy molekularne pozwala na szybką i specyficzną identyfikację problematycznych szczepów bakterii oraz grzybów bez wykorzystywania metod biochemicznych i immuno-enznymatycznych.

 

Standardowe badanie:

  • Posiew redukcyjny ~20-50 PLN
  • Posiewy różnicujące ~120 PLN
  • Barwienie ~25 PLN
  • Badania mikroskopowe
  • Testy immunoenzymatyczne ~25 PLN
  • Test biochemiczny API ~50 PLN
  • Chromatografia ~150-500 PLN

Koszt 240-720 PLN

 

Problemy biochemicznych i immuno-enzymatycznych metod identyfikacji:

  • Czas
  • Powtarzalność
  • Niezbędna interpretacja w oparciu o dane cząstkowe
  • długa droga do osiągnięcia klarownych wyników
  • nie zawsze jednoznaczne wyniki
  • problematyczne próbki środowiskowe
  • mikroorganizmy niespecyficzne, egzotyczne występujące w próbce

 

 

Badanie z użyciem analiz molekularnych

 

  • Posiewy redukcyjny ~20-50 PLN
  • Analiza molekularna: 3* dni + 200 PLN +VAT = klarowny wynik potwierdzony najdokładniejszą znaną metodą (Sekwencjonowanie Sangera)

Koszt: 220-250 PLN

Oszczędność od 20-470 PLN

 

Schemat postępowania analiza molekularna

 

  • Pobranie próbek, hodowla płynna lub płytkowa, lub pobrany fragment hodowli

  • Amplifikacja regionu:
    • 16S DNA
    • 18S DNA
    • ITS
  • Sekwencjonowanie

 

  • Analiza regionu

 

  • Typowanie gatunku
    • Candida orthopsilosis

 

Zalety identyfikacji molekularnej mikroorganizmów:

  • Dokładność metody - wyniki generowane na podstawie sekwencjonowania DNA metodą Sangera.
  • Wszechstronność - wyniki przyrównywane do międzynarodowych genetycznych baz danych mikroorganizmów.
  • Identyfikacja mikroorganizmów niespecyficznych, egzotycznych
  • Szybka realizacja
  • Zastąpienie lub uzupełnienie metod immunoenzymatycznych i biochemicznych

 

MLST

Charakteryzacja izolatów bakterii

Multi locus sequence typing (MLST) jest jednoznaczną procedurą charakteryzacji izolatów gatunków bakterii z wykorzystaniem sekwencji wewnętrznych fragmentów (zazwyczaj) siedmiu genów. Większość gatunków bakterii ma wystarczającą zmienność w obrębie genów, aby zapewnić rozróżnienie miliardów różnych szczepów bakterii.

 

Profile MLST można również uzyskać z materiału klinicznego bezpośrednio z CSF lub krwi. W ten sposób izolaty mogą być precyzyjnie scharakteryzowane nawet wtedy, gdy nie mogą być wyhodowane z materiału klinicznego.